Các nhà vi sinh học sử dụng nhiều thuật ngữ để mô tả độc tố Shiga và phân biệt nhiều hơn một dạng duy nhất. Nhiều thuật ngữ trong số này là từ đồng nghĩa.

Độc tố Shiga loại 1 và loại 2 (Stx-1 và 2) là độc tố Shiga được sản xuất bởi một số chủng E. coli. Stx-1 giống hệt với Stx của Shigella spp. hoặc khác nhau bởi chỉ một axit amin.[6] Stx-2 có sự bắt cặp trình tự lên đến 56% so với Stx-1. Cytotoxin - một ký hiệu cũ cho Stx - được sử dụng theo nghĩa rộng.

Verocytotoxin / verotoxin - một thuật ngữ ít được sử dụng cho Stx - chỉ sự mẫn cảm của các tế bào Vero với Stx.[7][8][9] Thuật ngữ độc tố giống Shiga là một thuật ngữ cũ xuất hiện trước khi phát hiện ra rằng độc tố giống shiga và độc tố shiga là một.[10]